Una de las cosas nuevas que tenemos con Team Foundation Server es el nuevo repositorio de código fuente, y esta es una de las cosas sobre las que mas dudas surgen y me preguntan en las charlas y formación que doy al respecto, el tema es que hay bastantes cambios (aunque la base de trabajo sigue siendo la misma) en la forma de trabajar si lo comparamos con el antiguo Source Safe, pues nada, para todas esas dudas, aquí veo en un blog un post con un documento resumiendo el nuevo modo de trabajar con Source Control, que es bastante interesante y resuelve bastantes dudas, espero que os ayude.
http://sstjean.blogspot.com/2006/10/document-from-vss-to-tfs-introduction.html
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